مرکز آموزش انجمن تحت عنوان سه مجوز آموزشگاهی دوره های خود را برگزار می نماید دوره‌های لجستیک بندری و دریایی با مجوز از سازمان بنادر و دریانوردی، آموزشگاه مهارتهای دریایی و بندری ایران که دوره های کاربردی و عملی را با مجوز از سازمان فنی و حرفه ای برگزار می نماید و همچنین دوره های کاربردی کوتاه مدت که به افزایش توان تخصصی کاری  و به روز بودن در زمینه کشتیرانی برگزار می‌شود.